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截至2017年，全国开设生物工程专业的高校数为251所，在上述院校中，生物工程专业的排名如下：
| 专业排名 | 学校名称 | 星级排名 |
| 1 | 上海交通大学 | 5★ |
| 2 | 江南大学 | 5★ |
| 3 | 浙江大学 | 5★ |
| 4 | 华中农业大学 | 5★ |
| 5 | 华东理工大学 | 5★ |
| 6 | 厦门大学 | 5★ |
| 7 | 西安交通大学 | 5★ |
| 8 | 南京工业大学 | 5★ |
| 9 | 西北农林科技大学 | 5★ |
| 10 | 天津科技大学 | 5★ |
| 11 | 重庆大学 | 5★ |
| 12 | 天津大学 | 5★ |
| 13 | 华南理工大学 | 5★ |
| 14 | 中国农业大学 | 4★ |
| 15 | 浙江工业大学 | 4★ |
| 16 | 沈阳药科大学 | 4★ |
| 17 | 东南大学 | 4★ |
| 18 | 大连工业大学 | 4★ |
| 19 | 四川大学 | 4★ |
| 20 | 中山大学 | 4★ |
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